Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-M3Q31093 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-M3Q31093 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms