Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim71Q1PSW8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim71Q1PSW8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms