Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Fam171bQ14CH0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam171bQ14CH0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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