Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3ip1Q149C2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3ip1Q149C2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms