Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms