Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps8Q0P5W1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms