Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ebf1Q07802 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms