Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntn3Q07409 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntn3Q07409 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms