Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gdf9Q07105 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gdf9Q07105 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms