Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprgQ05909 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprgQ05909 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms