Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Emx2Q04744 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Emx2Q04744 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms