Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pfdn6Q03958 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pfdn6Q03958 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms