Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnb1Q03717 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms