Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ddr1Q03146 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ddr1Q03146 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms