Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Muc1Q02496 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms