Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn1bP97952 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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