Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gfra1P97785 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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