Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cry1P97784 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cry1P97784 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms