Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smyd1P97443 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smyd1P97443 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms