Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RhodP97348 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RhodP97348 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RhodP97348 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RhodP97348 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RhodP97348 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms