Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccl21cP86793 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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