Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElocP83940 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElocP83940 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElocP83940 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElocP83940 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElocP83940 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElocP83940 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ElocP83940 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ElocP83940 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElocP83940 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElocP83940 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElocP83940 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElocP83940 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ElocP83940 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ElocP83940 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms