Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cbx1P83917 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cbx1P83917 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cbx1P83917 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cbx1P83917 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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