Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp9xP70398 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp9xP70398 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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