Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Lmo4P61969 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms