Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Copz1P61924 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Copz1P61924 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms