Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rin3P59729 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rin3P59729 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms