Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Setd4P58467 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Setd4P58467 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms