Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtnsP57757 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CtnsP57757 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms