Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CckbrP56481 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CckbrP56481 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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