Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Atp5eP56382 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms