Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bp1P55194 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms