Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Faf1P54731 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms