Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cacnb3P54285 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cacnb3P54285 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms