Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gpc4P51655 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms