Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TspoP50637 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TspoP50637 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TspoP50637 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TspoP50637 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TspoP50637 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TspoP50637 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TspoP50637 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TspoP50637 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TspoP50637 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
TspoP50637 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TspoP50637 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TspoP50637 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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