Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl5P50228 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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