Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP153P49790 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP153P49790 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP153P49790 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP153P49790 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP153P49790 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP153P49790 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP153P49790 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP153P49790 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP153P49790 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP153P49790 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP153P49790 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP153P49790 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP153P49790 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP153P49790 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms