Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psen1P49769 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psen1P49769 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms