Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rbp3P49194 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rbp3P49194 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms