Protein–RNA interactions for Protein: P48543

Kcnj9, G protein-activated inward rectifier potassium channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnj9P48543 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnj9P48543 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms