Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tac1P41539 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tac1P41539 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms