Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf3rP40223 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms