Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grik2P39087 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms