Protein–RNA interactions for Protein: P39053

Dnm1, Dynamin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnm1P39053 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnm1P39053 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnm1P39053 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnm1P39053 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnm1P39053 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnm1P39053 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnm1P39053 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnm1P39053 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnm1P39053 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms