Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms