Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LdlrP35951 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms