Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly6dP35459 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly6dP35459 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms