Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cd28P31041 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cd28P31041 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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