Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn10P28658 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms